Wybór najlepszego materiału prototypowego dla konkretnego produktu lub wynalazku zależy od wielu czynników, w tym budżetu, prezentacji, ramy czasowej i ilości. Ostateczna funkcja prototypowej części lub produktu zwykle określa materiał, z którego wykonany jest prototyp. Zbudowanie działającego prototypu może być prostym połączeniem kilku prostych materiałów lub przedmiotów znalezionych w domu. Materiały użyte do szybkiego prototypowania (RP) mogą zapewnić bardziej szczegółowy prototyp potrzebny do prezentacji inwestorom, inżynierom, marketerom, projektantom lub producentom. Inny prototypowy materiał obejmuje wzory wykonane z silikonowych form i różnego rodzaju tworzyw sztucznych lub kombinacji żywicy i innych materiałów.
Początkowo materiałem prototypowym może być drewno, glina, żywica lub połączenie tych i innych materiałów. Przed podjęciem decyzji, jakie prototypowe materiały lub procesy zostaną zastosowane, należy wziąć pod uwagę koszty. Niektóre z najbardziej udanych produktów zostały początkowo wykonane z bardzo surowych prototypowych materiałów lub przedmiotów znalezionych w domu, takich jak karton, drut i taśma klejąca. O ile pokazuje, jak działa produkt, do prototypu można użyć dowolnego rodzaju materiału. Jednym z rodzajów niedrogich prototypów jest specjalny plastik, który staje się miękki i podatny na formowanie po podgrzaniu w kuchence mikrofalowej lub suszarką do włosów.
